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Bei der Version 4.1 gibt es eigentlich keine Veränderung. Erst ab 4.2 muss man über die Seite Extensions bei Blender.org die Addons online holen.
Um welches Addon geht es denn konkret? Vielleicht hat der Addon-Ersteller noch nicht alles angepasst. Kommt bei kostenlosen Addons schon mal vor.
Seit 4.2 gibt es eine Änderung unter 4.1 läuft alles wie bisher. 
Das Bool Tool kommt mit Blender und muss nicht installiert werden sondern nur aktiviert.
So läuft es unter 4.2:
Auch in der Version 4.1 ist das Bool Tool bereits mit dabei und muss nur aktiviert werden (haken setzen links)
und dann ist es im N-Shelf rechts vom 3D-View zu finden:
