Ohne Konkretes Beispiel wirds schwierich.
Ich weiss nur das Geocraft Mesh überblendet.
Sowas kanst du in Blender auch machen . Dazu kannst du z.b den Mask Modifiere benutzen um die Face der Orginal Figur auszublenden so das dort nur der Geocraft mesh zu sehen ist. Dan gibs auch keine Probleme mit den Morphs.
Wenn der Auto mergen der Rigs probleme macht kann man es auch selber mach und z,b den Rig des Geocraft Mesh per Join mit dem Orginal Rig verbinden. Dazu solte man aber alle Bones die den gleichen Namen wie die Bones im Orginal Rig haben im Edit Mode löschen. Dann selectierst du den Rig des Geocraft Mesh und mit Shift Mausklick den Orginal Rig. Im Object Menü nun Join benutzen.